| 1+25 | 75 | Mattia Pasini | Aprilia · Polaris World | 39:47.944 | 1'42.811 | |
| 2+20 | 14 | Gabor Talmacsi | Aprilia · Bancaja Aspar | +4.774 | 1'43.097 | |
| 3+16 | 71 | Tomoyoshi Koyama | KTM · Red Bull KTM 125 | +8.576 | | |
| 4+13 | 33 | Sergio Gadea | Aprilia · Bancaja Aspar | +15.819 | | |
| 5+11 | 44 | Pol Espargaro | Aprilia · Belson Campetella Aprilia | +23.972 | 1'43.743 | 221.0 |
| 6+10 | 34 | Randy Krummenacher | KTM · Red Bull KTM 125 | +25.159 | 1'43.857 | 217.0 |
| 7+9 | 17 | Stefan Bradl | Aprilia · Blusens Aprilia | +25.391 | 1'43.831 | 215.8 |
| 8+8 | 38 | Bradley Smith | Honda · Repsol Honda 125cc | +25.513 | 1'43.888 | 217.2 |
| 9+7 | 35 | Raffaele De Rosa | Aprilia · Multimedia Racing | +25.994 | 1'44.213 | 218.0 |
| 10+6 | 60 | Michael Ranseder | Derbi · Ajo Motorsport | +26.239 | 1'44.085 | 214.8 |
| 11+5 | 12 | Tito Rabat | Honda · Repsol Honda 125cc | +26.693 | 1'43.410 | 215.2 |
| 12+4 | 6 | Joan Olive | Aprilia · Polaris World | +26.972 | 1'43.816 | 216.9 |
| 13+3 | 63 | Mike Di Meglio | Honda · Humangest Racing Team 125cc | +27.493 | 1'43.920 | 220.1 |
| 14+2 | 29 | Andrea Iannone | Aprilia · WTR Team | +32.894 | 1'43.848 | 215.6 |
| 15+1 | 11 | Sandro Cortese | Aprilia · Emmi - Caffe Latte Aprilia | +39.305 | 1'44.214 | 217.0 |
| 16 | 8 | Lorenzo Zanetti | Aprilia · Team Sicilia | +40.035 | 1'44.429 | 216.5 |
| 17 | 55 | Hector Faubel | Aprilia · Bancaja Aspar | +40.125 | 1'43.165 | 216.3 |
| 18 | 18 | Nicolas Terol | Derbi · Valsir Seedorf Derbi | +40.157 | 1'44.487 | 217.8 |
| 19 | 20 | Roberto Tamburini | Aprilia · Team Sicilia | +48.291 | 1'45.062 | 214.6 |
| 20 | 52 | Lukas Pesek | Derbi · Valsir Seedorf Derbi | +49.621 | 1'43.103 | 220.1 |
| 21 | 7 | Alexis Masbou | Honda · FFM Honda GP 125 | +50.496 | 1'44.224 | 217.5 |
| 22 | 42 | Simone Sancioni | Aprilia · RCGM Team | +57.519 | 1'44.901 | 215.1 |
| 23 | 77 | Dominique Aegerter | Aprilia · Multimedia Racing | +57.666 | 1'45.178 | 215.5 |
| 24 | 79 | Ferruccio Lamborghini | Aprilia · Junior GP Racing Team | +59.680 | 1'45.223 | 210.3 |
| 25 | 87 | Roberto Lacalendola | Aprilia · Ellegi Racing | +1:05.109 | 1'45.451 | 215.7 |
| 26 | 51 | Stevie Bonsey | KTM · Red Bull KTM 125 | +1:05.276 | 1'44.783 | 214.7 |
| 27 | 37 | Joey Litjens | Honda · Arie Molenaar Racing | +1:08.757 | 1'45.509 | 213.9 |
| 28 | 53 | Simone Grotzkyj | Aprilia · Multimedia Racing | +1:10.395 | 1'45.559 | 215.7 |
| 29 | 95 | Robert Muresan | Derbi · Ajo Motorsport | +1:18.572 | 1'45.449 | 213.2 |
| 30 | 99 | Danny Webb | Honda · Arie Molenaar Racing | +1:20.963 | 1'46.048 | 214.0 |
| 31 | 56 | Hugo Van Den Berg | Aprilia · Blusens Aprilia | +1:21.676 | 1'46.077 | 215.2 |
| 32 | 80 | Federico Biaggi | Friba · Friba | +1:54.228 | 1'44.976 | 215.4 |
| — | 24 | Simone Corsi | Aprilia · Skilled Racing Team | DNF | 1'43.156 | 218.9 |
| — | 27 | Stefano Bianco | Aprilia · WTR Team | DNF | 1'44.450 | 214.9 |
| — | 13 | Dino Lombardi | Honda · Scot Racing Team | DNF | 1'46.750 | 213.4 |
| — | 22 | Pablo Nieto | Aprilia · Blusens Aprilia | DNF | 1'45.542 | 214.3 |
| — | 15 | Federico Sandi | Aprilia · Skilled Racing Team | Out on lap 1 | | |